一、中文文獻
江大樹(2001)，《府際關係－府際關係導論》。台北市：元照。
余致力等(2000)，《公共管理》，黃榮護主編，台北市：商鼎文化。
林水波、李長宴(2005)，《跨域治理》。台北市：五南。
林水吉(2009)，《跨域治理—理論與個案研析》。台北市：五南。
林淑馨(2010)，《質性研究理論與實務》，台北市：巨流。
柯三吉(1995)，《我國水資源政策之探討：永續發展觀點》，台北市：時報文化出版公司。
孫本初(2010)，《新公共管理》第三版，台北市：一品文化。
潘淑滿(2003)，《質性研究理論與應用》，台北市：心理。
張潤書(1998)，《行政學》，台北市：三民。
鄧家基、駱尚廉、張長義、楊之遠與張祖恩(2012)，《對環境資源部的期望》，林志森主編，財團法人中技社專題報告，台北市：財團法人中技社。
王似華(2011)，〈以治理理論分析中共「大部制」改革之趨勢研究〉，《東亞研究》，42(2)：83-116。呂育誠(2012)，〈跨域治理概念落實的挑戰與展望〉，《文官制度季刊》，4(1)：85-106。
江明修、曾冠球(2009)，〈政府再造：跨部門治理的觀點〉，《國家菁英季刊》，5(1)：97-122。匡小平、吳軍民與王麗娟(2012)，〈大部制視角下交通運輸管理體制改革─一種跨個案研究的分析框架〉，《公共事務評論》，13(1)：65-74。
宋餘俠、謝偉智(2009)，〈行政組織改造設計原則與實務〉，《研考雙月刊》，33(3)：58-71。李長晏(2007)，〈中臺灣跨域治理案例之探討—以大甲溪流域管理為例〉，《中國地方自治》，60(5)：16-34。
李長晏(2009)，〈從協力治理模式探討淡水河流域的管理〉，《中國地方自治》，62(10)：3-19。
李柏諭(2010)，〈跨域公共事務的管理邏輯：治理演化的類型分析〉，《文官制度季刊》，2(4)：1-39。
沈世宏(2011)，〈打造環境永續的綠色臺灣－環境資源部未來展望〉，《研考雙月刊》，35(2)：131-135。紀俊臣(2001)，〈台灣府際關係緊張與解決機制之評析〉，《國教新知》，48(1)：34-43。馬念和(2001)，〈流域水資源管理〉，《水資源管理季刊》，3(3)：20-24。
曾冠球、江明修(2010)，〈跨機關合作中的政治與官僚辯證：「行政團隊」與「首長間信任建立」之意涵〉，《國家與社會期刊》， 8：1-46。曾怡仁、黃競涓(2000)，〈府際關係研究分析－兼論水資源管理個案〉。《公共行政學報》，4：241-257。張四明(1998)，〈府際間的協調：問題與解決途徑〉，《行政學報》，29：213-250。張四明(2001)，〈從府際關係運作的觀點特討我國山坡地開發管制政策之執行〉，《行政暨政策學報》，33：77-100。陳金貴(1990)，〈美國府際關係和府際管理的探討〉，《行政學報》，22：13-26。陳明健(1995)，〈台灣的水資源管理－制度、經濟與政策的整合〉，《自由中國之工業》，84(5)：31-41。陳德新(2010)，〈行政院組織改造之法治配套措施〉，《研考雙月刊》，34(2)：57-62。陳敦源、劉宜君、蕭乃沂與林昭吟(2011)，〈政策利害關係人指認的理論與實務：以全民健保改革為例〉，《國家與社會期刊》，10：1-65。
陳立剛、王輝煌與陳朝建(2012)，〈行政院與地方政府在組織改造後業務窗口對應之研析〉，《研考雙月刊》，36(2)：53-66。
楊永年(2009)，〈八八水災救災體系之研究〉，《公共行政學報》，32：143-169。
趙永茂(2003)，〈台灣府際關係與跨域管理：文獻回顧與策略途徑初探〉，《政治科學論叢》，18：53-70。蔡文軒(2011)，〈重塑黨國體系？中國大陸地方「大部制」改革的探討〉，《公共行政學報》，41：73-102。鄭晉昌、劉曉雯、林俊宏與陳春希(2006)，〈多向度之管理職能評鑑與主管級員工績效及績效改善之關係：一項結合橫貫面與縱貫面之研究〉，《人力資源管理學報》，6(4)：1-21。
駱尚廉、顏秀慧(2002)，〈環境資源主管機關之定位及職權探討〉，《國家政策季刊》，創刊號：183-194。彭錦鵬(2005)，〈全觀型治理：理論與制度化策略〉，《政治科學論叢》，23：61-100。
陳立剛(2001)，〈府際合作關係之研究：跨區域管理合作模式之分析及其策略〉，發表於《府際關係學術研討會》（10月30-31日），台北：內政部。
劉麗娟(2015)，〈老人服務之跨部門治理結構分析：以臺東縣池上鄉為例〉，發表於《臺灣政治學年會「民主與治理的挑戰」》（11月14-15日），金門：臺灣政治學會。
吳仁豪(1999)，《我國流域水資源管理制度之革新》，中山大學公共事務管理系碩士論文。林瑞卿(2002)，《我國水資源機關功能整合之探討－組織重組的觀點》，暨南大學公共行政與政策學系碩士論文。
江孟達(2006)，《地方政府間跨域管理之研究—以宜蘭與花蓮垃圾處理議題為例》，國立東華大學公共行政研究所碩士論文。李長晏(1999)，《我國中央與地方府際關係分析：英國經驗之學習》，國立政治大學公共行政學系博士論文。林瑞卿(2002)，《我國水資源機關功能整合之探討—組織重組的觀點》，國立暨南國際大學公共行政與政策學系碩士論文。
秦書彥(2000)，《中央與地方關係之歷史檢視與改革之道》，國立政治大學公共行政系碩士論文。曹晉瑞(2009)，《焚化爐停建後一般廢棄物處理政策之研究－以跨域管理觀點探討》，中華大學行政管理學系碩士論文。陳曉芬(2001)，《南部地區節約用水之經濟效益模擬分析》，成功大學資源工程研究所碩士論文。陳麗娟(2006)，《從跨域管理觀點論述災害防救組織—以行政院災害防救委員會為例》，世新大學行政管理學系碩士論文。張慈慧(2004)，《從跨域管理觀點－探討台十六線公路砂石車問題》，逢甲大學公共政策所碩士論文。黃聖銘(2000)，《我國地方水利事權整合之研究》，中山大學公共事務管理研究所碩士論文。
楊明洲(2005)，《台灣地區水資源管理問題之探討－跨域管理之研究途徑》，國立成功大學政治經濟學研究所碩士論文。劉凱旋(2002)，《台灣河川管理之探討－以八掌溪為例》，東海大學公共事務研究所碩士論文。廖永來(2005)，《跨域管理服務機制之研究—以行政院中部聯合服務中心為例》，東海大學公共事務碩士學程在職進修專班碩士論文。廖洲棚(2011)，《行政組際協調之嵌套賽局分析：以臺北市1999 陳情案件為例》，國立政治大學公共行政學系博士論文。趙容瑄(2006)，《府際關係與跨域管理機制之建構—行政院中部聯合服務中心之重構為例》，臺灣大學政治學系碩士論文。鄧宜菁(2004)，《高科技公司法務與研發部門之互動行為與協調模式－以台灣IC 設計公司之智慧財產權管理為例》，國立政治大學科技管理研究所碩士論文。謝杏慧(2013)，《跨部門及組織間協力關係網之研究：以多元就業開方案中彰投區為例》，國立臺北大學公共行政暨政策學系博士論文。鄭崇田(2000)，《政經變遷中我國府際關係的發展》，國立暨南大學公共行政與政策學系碩士論文。鄭詩涵(2005)，《統管流域水資源之跨域管理探討—以臺北縣市為例》，中華大學經營管理研究所碩士論文。龔意琇(2002)，《台灣垃圾跨區域處理之個案研究》，國立台灣大學政治系碩士論文。李再長、曾雅芬譯(2010)，台北市：新加坡商聖智學習。譯自Richard L. Daft. Understanding the Theory and Design of Organizations. Mason, OH: South-Western Cengage Learning. 2010.
楊幼蘭譯(2005)，《變革管理》。台北市：天下文化。譯自Richard Luecke. Managing Change and Transition Paperback. Massachusetts: Harvard Business Essentials. 2003.
史美強、孫同文、張育哲(2010)，《行政院組織改造後公務機關橫向聯繫及服務流程整合之研究》，台北市：行政院研究發展考核委員會，計畫編號：RDEC-TPG-099-005。
行政院經濟建設委員會(2004)，《行政革新與政府再造之落實》，台北市：國家發展委
員會 ，計畫編號：93063.122。
張四明、呂育誠、黃榮源與陳耀祥(2014)，《中央與地方行政機關組織職能對應比較之研究》，台北市：國家發展委員會，計畫編號：NDC-DSD-103-004。
陳敦源(2012)，《中央三級機關（署、局）組織運作及二級機關對其指揮監督之研究》，台北市：行政院研究發展考核委員會，計畫編號：RDEC-RES-100-011。
郭昱瑩、蕭全政(2013)，《行政院組織改造已施行機關之效益研析》，台北市：行政院研究發展考核委員會，計畫編號：RDEC-PLN-102-002。
胡龍騰、曾冠球(2009)，《電子治理下的跨域整合管理：個案評估》，台北市：行政院研究發展考核委員會，計畫編號：0972461343。
立法院(2011)，〈立法院第7屆第7會期司法及法制、社會福利及衛生環境委員會第2次聯席會議紀錄〉，《立法院(3896)公報》，100(44)：170。
立法院(2012)，〈立法院第8屆第1會期司法及法制、社會福利及衛生環境委員會第2次聯席會議紀錄〉，《立法院(3979)公報》，101(38)：269-358。
立法院(2013)，〈立法院第8屆第3會期司法及法制、社會福利及衛生環境委員會第1次聯席會議紀錄〉，《立法院(4046)公報》，102(21)：271-390。
行政院國家科學委員會(2011)，〈行政院組織改造推動現況與展望〉，《中華民國科學技術年鑑》，100 年版：13-22。
行政院環境保護署(2012)，《101年版環境白皮書》。台北市：五南文化。
行政院環境保護署(2013)，《102年版環境白皮書》。台北市：五南文化。
行政院環境保護署(2014)，《103年版環境白皮書》。台北市：五南文化。
呂育誠(2009)，〈鄉鎮市防救災工作的跨域管理與跨單位整合〉丘昌泰編，《地方政府公共管理個案選輯第一輯》，台北：行政院人事行政局地方行政研習中心。
二、外文文獻
Bryson, J. M., Crosby, B. C. and Stone, M. M. 2006. "The Design and Implementation of Cross-Sector Collaborations: Propositions from the Literature." Public Administration Review, 66(S1):44-55.
Christensen, T. and P. Læ greid. 2004. "Government autonomisation and control: The Norwegian way." Public Administration and Development, 24:129-135.
Christensen, T. and P. Læ greid. 2007. "Introduction-Theoretical Approach and Research Questions." In T. Christensen, and P. Læ greid eds. Transcending New Public Management (p. 1-16). Burlington: Ashgate Publishing Company.
Christensen, T., A. Lie, and P. Læ greid. 2007. "Still Fragmented Government or Reassertion of The Centre?" In T. Christensen, & P. Læ greid eds. Transcending New Public Management (p. 17-41). Burlington: Ashgate Publishing Company.
Deil. S. Wright. 1988. Understanding Intergovernmental Relation. Belmont: Wadsworth Deil S. Wright. 1990. "Federalism, Intergovernmental Relation, and Intergovernmental Management : Historical Reflections and Conceptual Comparisons." Public Administration Review, 50:168-178.
Dong, L, T. Christensen, and M. Painter. 2010. "A Case Study of China’s Administrative Reform: The Importation of The Super-Department." The American Review of Public Administration, 40(2): 170-188.
Downs A. 1967. Inside Bureaucracy. Boston：Little, Brown and Company.
Hannan, M. T., and Freeman J. 1989. Organizational Ecology, Massachusetts: Havard University Press.
Hood C. 1991. "A Public Management For All Season?" Public Administration Review, 69(1):3-19.
Jones, Gareth R. 2004., Organizational theory, Design, and Change-text and case. New Jersey:Pearson Education Upper Saddle River.
Jun, J. S. 2009. "The Limits of Post-New Public Management And Beyond." Public Administration Review, 69(1):161-165.
Lan, Z. 2001. "Understanding China’s Administrative Reform." Public Administrative Quarterly, 24(4): 437-468.
Leavitt, Harold J. 1965. Applied Organization Change In Industry, in .G. March. eds.
Handbook of Organization, Chicago : Rand McNally.
Ling, T. 2002. "Delivering Joined-Up Government In The UK: Dimensions, Issues And Problems." Public Administration, 80(4):615-642.
Milkis, S. M. 1993. The President And The Parties: The Transformation of The American Party System Since The New Deal. New York: Oxford University Press.
Perri 6. 1997. Hoslistic Government. London: Demos.
Peters, Guy B. 2006. "Concepts and Theories of Horizontal Policy Management.", In Guy Peters and Jon Pierre eds. Handbook of Public Policy:115-138.
Pollitt, C. 1980. "Rationalizing the machinery of government: The conservatives, 1970-1974." Political Studies, 28(1):84-98.
Pollitt, C. 2003. "Joined-up government: A survey." Political Studies Review, 1:34-49.
Pressman, J. L. and A. B. Wildavsky. 1984. Implementation: how great expectations in Washington are dashed in Oakland. (2eds.). Berkeley: University of California Press.
Thompson, A.M. and J. L. Perry. 2006. "Collaboration Process: Inside the Black Box." Public Administration Review, Special Issue: 20-32.
Thompson, J. D. 1967. Organizations in Actions. New York.
Vockell, E. L., and Asher, J. W. 1995. Educational Research. New Jersey: Englewood Cliffs.